Fakultas Teknik mempunyai sejarah yang cukup lama dan merupakan institusi tertua di kota Bogor dan bidangnya. Didirikan pada tahun 1974, fakultas teknik pada mulanya hanya mempunyai satu Program Studi yaitu Teknik Sipil. Baru beberapa tahun kemudian Program Studi Teknik Elektro didirikan (tepatnya pada tahun 1978), kemudian disusul dengan Program Studi Teknik Mesin dan Teknik Informatika. Seiring dengan perkembangan regulasi dan pengembangan institusi maka sejak tahun 2018 Fakultas Teknik berganti nama menjadi Fakultas Teknik dan Sains melalui Keputusan Rektor Nomor: 010/K.13/IIIa/KR-PNFT/UIKA/2018. Pada tahun 2022, Fakultas Teknik dan Sains membuka 3 program studi baru, sehingga Fakultas Teknik dan Sains mempunyai 7 Program Studi. Empat program studi di FTS terakreditasi Baik Sekali oleh LAM Teknik, dan tiga program studi dengan status Terakreditasi dari BAN PT